En pleine époque Shoguns, un seigneur abuse de son autorité et de sa force pour contraindre le peuple à assouvir ses envies. Treize hommes se réunissent pour former un groupe de treize assassins, afin de mettre un terme aux méfaits du seigneur des terres. C’est ainsi que ces hommes, emplis...
En 1879, Kenshin se bat avec ses alliés contre son plus grand ennemi : son ancien beau-frère Enishi Yukishiro, entouré de ses sbires qui ont juré de se venger.
Durant la dynastie Qin, pendant la période des états belligérants dans la Chine ancienne, Shin était un orphelin de guerre. Il rêve de devenir un grand général. Shin rencontre le jeune roi Eisei qui vise à unifier toute la Chine.
Huit mois après les derniers événements, alors que Genji est sur le point d'être diplômé du lycée Suzuran, il se voit contraint de régler une dernière affaire avec une école rivale.