Japon féodal, ère Edo : Ittô Ogami est le bourreau officiel du Shôgun. Cette fonction, convoitée par tous les maîtres d'armes de la cour, consiste à décapiter les suzerains vassaux condamnés, pour rébellion, au hara-kiri. Elle procure le privilège d'arborer le blason du Shôgun, d'être...
À la suite de son évasion, Nami, surnommée Sasori, est activement recherchée par la police. Elle leur échappe dans le métro, après avoir coupé le bras d'un inspecteur, et trouve refuge dans un quartier sordide, chez une prostituée.
Okumura, un flic chevronné, est en première ligne pour enquêter sur le groupe yakuza Seijin-kai en pleine ascension. Il se met à la recherche d’un de leur membre qui a tué un policier après une transaction d’armes.
Yumi vit chez sa mère Tomi, hôtesse de bar. Elle n’a jamais connu son père, et partage le toit avec l’ami de sa mère. Celui-ci l’agresse sexuellement, et Tomi finit par le tuer, et devra donc en répondre en justice. Yumi va alors devoir se prendre en main.
Le moine défroqué Shinkai va devoir affronter les adorateurs d'un culte sexuel, et un groupe de nationalistes fanatiques qui retiennent en otage les habitantes d'un petit village de pêcheurs. Mais c'est sans compter sur le retour de son pire ennemi.
Un agent secret du shogunat est envoyé pour enquêter sur un accord secret avec un navire de guerre néerlandais impliquant des fusils à répétition à utiliser lors d'un soulèvement contre le Shogun, mais découvre qu'il se passe plus de choses qu'on ne le pensait auparavant. Au cours de sa...