Une tempête effroyable se déchaîne sur le Pacifique, engloutissant un pétrolier tandis qu'un immense éclair illumine le ciel au-dessus de la Polynésie française. Des empreintes géantes creusent un inquiétant sillon à travers des milliers de kilomètres de forêts et de plages au Panama....
Un athlète de renom rentre chez lui à contrecœur pour reprendre le rôle d'Ultraman après son père et protéger Tokyo des monstres géants. Il va devenir un héros légendaire.