Lorsque Emil se déplace en bus à Berlin pour rendre visite à sa grand-mère et son cousin, son argent est volé par un escroc qui se spécialise dans le creusement des tunnels. Emil doit obtenir l'argent pour sa grand-mère. Tout en suivant le voleur, Emil se heurte à Gustav, un jeune garçon...
Emil se rend à Berlin pour voir sa grand-mère avec une grosse somme d'argent et se voit offrir des bonbons par un homme étrange qui l'endorment. Il se réveille à son arrêt sans argent. C'est à lui et à un groupe d'enfants de sauver la situation.
