Dans un futur alternatif, après des décennies de guerre, le monde a fini par arriver à une paix durable. Mais les Terriens ont désespérément besoin de retrouver un peu d'action. Pour apaiser ses citoyens, le gouvernement met alors en place un cycle de guerres d'un genre nouveau : celles-ci...
À la suite d'une promesse faite à Mark Williams, un vieil ami cambrioleur décédé, Edgar / Lupin III doit restituer tous les objets volés par Mark dans le temps. Si il réussit, Edgar pourra connaitre l'emplacement du fameux « Diamant Trique » que convoite également Magali / Fujiko ainsi...
Prenant place après les événements de la série, les Taros et Kohana sortent du Den-Liner pour rendre visite à Ryotaro et Airi. Cependant, ils voient un mystérieux train fantôme qui était mentionné dans les légendes urbaines. Momotaros et les autres sont attaqué par deux Imagin et Kamen...