L’histoire se déroule à une époque où le monde a été ravagé par un poison, appelé Shinobi, venu sur Terre par un astéroïde. Les gens s’enfuient dans le lieu appelé Kairiku, un endroit qui était autrefois le fond de l’océan. Cependant, le Giga Road et le guerrier légendaire...
L'académie Nanyo part en voyage scolaire en direction de Kyoto mais ce ne sera pas de tout repos. Les autres écoles de la région du Kanto (à savoir Rakuyo, Kyosho, Yoshu ou encore Seito) se retrouvent eux aussi à Kyoto pour leur voyage scolaire... Coïncidence ? En réalité, une immense...
