Réparti sur trois périodes (l'été il y a dix ans, l'été il y a cinq ans et cet été), Lost Virgin raconte l'histoire de Chisato (Sasaki), une jeune femme qui aime s'amuser, avide de nouvelles expériences, mais qui recherche avant tout l'épanouissement émotionnel.
Cinq personnes suicidaires se rencontrent sur Internet et forment un "groupe suicide". Ils se donnent rendez-vous au domicile de l'un d'entre eux pour passer leurs dernières heures ensemble.