Dans un Tokyo futuriste, une immense guerre des gangs fait rage et divise la ville en quatre clans qui veulent imposer leurs règles. À la tête de deux bandes, deux anciens amis rivalisent et les rancoeurs et sentiments personnels viennent se mêler aux affrontements des hommes dans un chaos...
Se déroulant après la fin de la série, Doubutsu Sentai Zyuohger Returns se concentrera sur les Zyumans et les humains qui coexistent pacifiquement sur Terre. Il est alors décidé qu'ils auront une bataille pour déterminer qui gouvernera la Terre, mais un réel danger se cache dans l'ombre.