La rumeur veut que la maison de Prague cache un secret pour obtenir la pierre philosophale, et un labyrinthe complexe à plusieurs niveaux de tunnels souterrains et de caves recèle de nombreux mystères non résolus et des trésors indicibles.
Il s'agit de la suite du film, Le brave soldat Chvéik de 1956. Les deux films ont été tournés d'après le roman Les Aventures du brave soldat Chvéik de l'écrivain Jaroslav Hasek. Le film se termine sans dénouement au milieu des troubles de la guerre, tout comme le roman inachevé de Hasek.
Une vieille femme est surprise à voler une hostie consacrée pendant la messe pour guérir une vache qui ne donne plus de lait. Le curé y voit signe de sorcellerie et demande à la seigneurie locale d'ordonner un tribunal d'inquisition pour juger les coupables au grand dam du clergé de la ville...
Diverses scènes de la vie d'une communauté soudée en Tchécoslovaquie explorant l'esprit humain dans le contexte des changements politiques qu'ils vivent.