Au XVIe siècle, au Japon, des paysans décident d'embaucher des samouraïs pour protéger leur village, et en trouvent sept. Ces hommes organisent la défense du village contre quarante brigands.
Atteint d'un cancer, Watanabe, chef de service du génie civil, décide de réaliser le projet qu'il avait tout d'abord repoussé : celui d'assainir un terrain vague du quartier de Hureocho pour que les enfants puissent jouer dans un véritable jardin.
Une série de naufrages inexpliqués défraie la chronique japonaise. Au même moment, à la suite de plusieurs pêches infructueuses, les insulaires de l'île Odo organisent une cérémonie pour apaiser la colère de "Gojira", un dragon marin vénéré depuis des temps immémoriaux. Mais la nuit...
L’amiral japonais Isoroku Yamamoto, brillant tacticien, est un fidèle sujet de l’empereur, malgré ses graves réticences à mener la marine japonaise dans la guerre avec les États-Unis. Il s'oppose à l'attaque de Pearl Harbor, sa demande ayant été rejetée, il conduit ses forces au mieux...