La Bat-famille revient dans le présent et découvre que le Japon a disparu et qu'une île géante appelée "Hinomoto" est apparue dans le ciel de Gotham City. À son sommet se trouve la Ligue des Yakuza, un groupe d'individus sans foi ni loi qui ressemble étrangement à la Ligue des Justiciers....
Lorsqu'un dossier top secret est volé par effraction dans les labos de S.T.A.R. par Poison Ivy et Floronic Man, alias Jason Woodrue, une vague de crimes et de chaos se déclenche. Le Chevalier Noir et Nightwing sont sur l'affaire mais font appel à une aide innatendue: Harley Quinn !
Lex Luthor repense au passé glorieux de Superman et se dit qu'il doit mourir. L'entreprise LexCorp découvre un appareil d’origine extra-terrestre. Un hologramme les avertit dans une langue inconnue du danger imminent que représente l’arrivée de Doomsday sur Terre. Alors sort un être...