Hilarion Zabala perd à nouveau son odorat. Un conseiller soupçonne qu'il s'agit d'un cas persistant de phantosmie, une odeur fantôme, peut-être causée par un traumatisme. L'un des processus recommandés pour guérir le mal est que Hilarion replonge dans ses souvenirs...
Une fresque cinématographique en 3 parties sur la révolution philippine contre le régime colonial espagnol à la fin du 19ème siècle. Isagani, étudiant naïf, brillant et poète, se laisse influencer par le ténébreux Simoun, un radical qui prône la violence au nom de la libération....