De passage dans une auberge, Zatoichi se trouve fortuitement au chevet d'une femme à l'agonie et recueille ses dernières volontés : retrouver le géniteur de son enfant, un nommé Shokichi, artiste peintre au village de Maébara. Arrivé à destination, le masseur découvre bientôt que le père...
Une princesse d'un indigne clan et de son fidèle serviteur souhaite effacer leur nom de famille. Un rival du clan veut détruire la famille Yagyû. Seul le maître épéiste, Yagyû Jûbei se trouve sur leur chemin. Quel est le secret caché dans les parchemins ?
La famille Yagyu a enseigné le style d'escrime Shinkage depuis les générations. Maintenant, une nouvelle école a ouvert à Edo, qui prétend être le vrai style Shinkage. Yagyû Jûbei est face à son plus grand défi quand le maître de la nouvelle école prétend qu'il est le successeur...
Lorsque le clan Yagyû est victime des espions rivaux de Kasumi, Yagyû Jûbei est appelé à l'action pour les protéger. Mais dans l'accomplissement de son devoir, il devient la cible de ceux qui veulent détruire son clan.
