Mexique, 1900, pendant le règne du dictateur Porfirio Diaz. Un prêtre, Nazarin, protège les parias et subit l'opprobre de ses pairs et de ceux qu'il défend. A cause de sa grande charité, lui-même vit dans une indigence proche de la misère. Il se sacrifie et se dévoue tout en se sachant...
L'histoire d'un homme discipliné et sexuellement motivé qui maintient sa famille isolée dans sa maison pendant des années afin de les protéger de la « nature perverse » des êtres humains tout en inventant (avec sa femme) de la mort aux rats.
