Masakazu Isshiki est un écrivain mystèrieux. Il vit à Kamakura avec sa femme Akiko qui est beaucoup plus jeune que lui. Ils résolvent les affaires bizarres et inexpliquées qui se déroulent autour d'eux.
Un homme nommé Shouichi Tsugami a perdu ses souvenirs. Il ne sait pas qui il est, d'où il vient, ou comment il est venu sur ses circonstances particulières. Tsugami, apparemment sans raison, se transforme en un puissant surhumain, Kamen Rider Agito , chaque fois en présence des êtres...
