Une nouvelle année scolaire commence pour Trevor McKinney, un garçon de douze ans, une année qui ne ressemblera à aucune autre et changera peut-être la vie de milliers d'hommes. Le jour de la rentrée, Trevor reçoit de la part de son professeur Eugene Simonet un sujet de devoir pour le moins...
Depuis des siècles, les Ninjas se transmettent en secret leur art. Et la legende veut qu'un jour, un enfant venu de l'Ouest soit le plus grand maître de cet art. Découvert orphelin sur les côtes du Japon et adopté au sein du clan, Haru pourrait bien être celui-la. Ou peut-être pas !