Après la mort de Neteyam, Jake et Neytiri affrontent leur chagrin tout en faisant face au Peuple des Cendres, une tribu Na’vi redoutable menée par le fougueux Varang, alors que le conflit sur Pandora s’intensifie et qu’une nouvelle quê morale s’amorce.
Une dizaine d'années s'est écoulée depuis les précédents évènements survenus sur Pandora. Jake Sully et Neytiri sont devenus parents. Leur vie idyllique, proche de la nature, est menacée lorsque la « Ressources Développement Administration », dangereuse organisation non-gouvernementale,...
Lorsque le prédicateur laïc Thomas Munro arrive dans une colonie britannique de la Nouvelle-Zélande des années 1830, son passé violent est rapidement remis en question et sa foi mise à l'épreuve, car il se retrouve pris au milieu d'une guerre sanglante entre tribus Māori.