Portrait du pape Pie XII (1876-1958), chef de l'Église catholique de 1939 à sa mort, qui, pendant la Seconde Guerre mondiale, et alors que les Juifs d'Europe étaient exterminés par les nazis, fut accusé de garder un silence déconcertant et honteux.
Au 19ème siècle, Edgardo Mortara, jeune garçon de confession juive ondoyé secrètement par une employée de maison, est enlevé par les autorités catholiques. Conduit à Rome et rebaptisé Pio, il devient un symbole d'opposition entre l'Eglise et les autorités juives...