Au sein du harem d'Edo, deux nouvelles venues se heurtent aux intrigues politiques, aux rivalités et à un esprit vengeur que seul un apothicaire itinérant peut vaincre.
Après un mois de décembre épuisant, Sakuta approche rapidement de la fin de sa deuxième année de lycée. Comme Mai est en troisième année, il ne leur reste plus beaucoup de temps à passer ensemble avant l'obtention du diplôme. Pendant ce temps, Kaede s'aventure de nouveau, lentement mais...
Alors que la cérémonie de graduation des troisième années se terminent, le groupe µ's s'était fait à l'idée que son parcours s'arrêterait là. Effectivement, trois de leur membres qui étaient en troisième année viennent d'être gradués du lycée et n'ont donc plus le statut de School...