Sakuta Azusagawa, élève de 1ère, habite Fujisawa, une ville où resplendissent ciel et mer. Il vit un quotidien palpitant avec sa petite amie Mai Sakurajima, jusqu'au jour où débarque son premier amour, Shôko Makinohara, en qui cohabitent en fait deux personnes : une adulte et une...
Enfin, le jour de la remise des diplômes du lycée de Mai est arrivé. Alors que Sakuta attend avec impatience sa petite amie, une élève du primaire qui lui ressemble exactement apparaît devant lui. Suspect, et pour toutes les mauvaises raisons... Pendant ce temps, le père de Sakuta et Kaede...
L'histoire suit une fille nommée Akeno Misaki qui s'inscrit au lycée marin des filles de Yokosuka, Kanagawa afin de devenir l'une des sirènes bleues les plus appréciées.