D'étranges visiteurs puissants et soi-disant pacifiques, les Mysterians, récemment débarqués sur la Terre, demandent au gouvernement de leur fournir quelques jolies jeunes femmes afin de perpétuer leur race en voie d'extinction.
Les survivants d'un naufrage, menés par le professeur Murai, échouent sur une île inconnue. Là, ils découvrent la carcasse d'un bateau recouverte d'étranges champignons. Bientôt, ils vont découvrir qu'ils ne sont pas seuls à peupler cet endroit mystérieux...
À la fin du XXe siècle, les monstres sont parqués sur l’île d’Ogasawara. Ils sont retenus sur l’île par des moyens prodigieux. Mais un jour, les barrières se dissipent et les monstres s’évadent. L’équipe du SY-3 est chargée d’enquêter. Ils se retrouvent face aux Kilaaks, des...
Tami, Shinjiro, Tateo et Minako passent les vacances d'été chez leur grand-mère Kane, à quelques kilomètres de Nagasaki. La vieille dame a envoyé les parents des enfants à Hawaii, où l'un de ses frères, émigré depuis bien longtemps déjà, souhaite la revoir une dernière fois avant de...
Les survivants d'une épave se trouvent sur une île vraisemblablement inhabitée et irradiée. Une expédition conjointe de scientifiques roliscains et japonais explore l'île et découvre une population indigène et les minuscules Shobijin, deux prêtresses jumelles de la divinité de l'île,...
Lorsqu’une espèce rare de papillon est découverte dans une vallée mystérieuse du Japon, deux entomologistes vont enquêter et en trouver d’autres. Ils découvrent Varan, un monstre géant, qui décide de quitter la vallée et de se diriger directement vers Tokyo.
Les nymphes jumelles de Mothra et les enfants de la ville trouvent une ville perdue, ainsi qu'un monstre géant attiré par les calamités environnementales.
Dans les bas-quartiers, Matajuro, ancien samouraï sans le sou, vit sur le maigre salaire de sa femme dévouée qui confectionne des petits ballons de papier, tandis que Shinza le barbier organise illégalement des jeux d'argent et s'attire les foudres d'un gang local.