Sous le pseudonyme du « Lézard Noir », une sanguinaire voleuse de bijoux, criminelle de haute volée, et son gang cherchent par tous les moyens à kidnapper la fille d'un très riche bijoutier.
Tora-San, un colporteur ambulant qui est expulsé de la maison de son père vingt ans auparavant mais renoue avec sa tante, son oncle et sa sœur Sakura. Tora fait des ravages dans leur vie, comme se saouler et faire l'idiot lors d'une réunion de mariage et ruiner la chance de Sakura d'épouser...
Alors qu’il voyage dans le nord du Japon, Tora retrouve par hasard Lily, à Hakodate, à Hokkaidô. Elle lui explique qu’elle a divorcé et qu’elle est retournée à son ancienne vie de chanteuse.
A la fin du 19ème siècle, un samourai (Sugi Toranosuke), déchiré entre son dévouement pour un Shogun vieillissant et les conseils de son ancien professeur, entre finalement en guerre pour venger la mort de ce dernier.
Japon, années soixante : dans l'euphorie du boom économique, l'argent coule à flots. Shun, chef d'un gang de jeunes voyous, tente sa chance en se spécialisant dans les affaires de chantage.
A Nagoya, Tora a gagné gros aux courses. De retour à Shibamata, il exhibe ostensiblement un portefeuille bourré de liasses de billets et décide d’offrir à son oncle et à sa tante un voyage à Hawaï.
Une lettre arrive pour Tora de la part de Lily (Ruriko Asaoka) dont il n’avait plus de nouvelles : elle est hospitalisée après avoir fait un malaise sur son lieu de travail à Okinawa. Le camelot se rend à Naha pour répondre au souhait de Lily de le revoir. Il se montre dévoué et aux petits...
À Shibamata, les Kuruma ont décidé de louer une chambre à une belle femme nommée Yûko, une parente éloignée de tante Tsune. De retour chez lui, le très sensible Tora en tombe naturellement amoureux d'elle.
Kiku, la mère de Tora, revient à Tôkyô pour la première fois en trente ans. Tora veut organiser une rencontre avec Sakura. Une terrible dispute met fin à ce projet. Fâché, Tora repart sur les routes.
Après un an d'absence, Tora revient à Shibamata, le quartier de son enfance à Tokyo. Après des retrouvailles un peu agitées, il décide de partir pour Kyoto pour retrouver sa mère, Kiku, dont il rêve souvent.
Une jeune femme samouraï rencontre un messager mourant et accepte de lui remettre le parchemin qu'il transportait à destination. Cependant, à son insu, le rouleau est en fait la formule d'une nouvelle sorte de poudre à canon. Un clan maléfique qui projette de renverser l'empereur est...
