Au Japon, dans la ville de Karakura, des esprits font leur apparition. Le monde est alors menacé de destruction par le groupe Dark One. Ichigo et ses amis vont tout tenter afin de sauver le monde.
Suite au massacre de Nibelheim par Sephiroth, Zack et Cloud tentent de fuir les forces de la Shinra et les Turks afin de rentrer à Midgar. Leur fuite est entrecoupée de flash-backs autour des événements ayant eu lieu à Nibelheim.
À la suite d'une promesse faite à Mark Williams, un vieil ami cambrioleur décédé, Edgar / Lupin III doit restituer tous les objets volés par Mark dans le temps. Si il réussit, Edgar pourra connaitre l'emplacement du fameux « Diamant Trique » que convoite également Magali / Fujiko ainsi...
Après un hold-up réussi à l'hippodrome, Lupin vise un précieux diamant serti qui sera exposé dans sept jours. Son plan est compliqué lorsqu'il sauve une jeune fille nommée Michelle d'un groupe de voyous. Le père de Michelle est très riche et lié au diamant ; son père enrôle également...
Lupin vole une gemme extraordinaire à une fête méditerranéenne, mais il est interrompu par Pycal, le "magicien" qui est apparemment mort en combattant Lupin au début de sa carrière. Pycal, désormais armé de réelles capacités magiques, est déterminé à se venger.