Hors-la-loi, El Topo défie pour l'amour d'une femme les Quatre Maîtres du Désert. Les ayant vaincus, sa conscience s'élève jusqu'à ce que sa femme le trahisse. Sa nouvelle vie d'homme saint commence alors et El Topo s'engage dans la libération d'une communauté de parias.
L'histoire se passe autour du 13 août 1961, jour de la construction du Mur de Berlin. Un membre d'une des milices ouvrières, qui gardent les maçons érigeant le Mur, empêche son demi-frère de fuir à l'Ouest.
Tex est boucher et marié à la belle Candy, dont la fidélité n'est pas la qualité première. Las d'être cocu, il la tue et la découpe en morceaux. Il part enterrer les reliques dans le desert, près de la frontière mexicaine. En route, il perd une main, raidie dans une position plutot...
John McCanless est un ancien bandit armé devenu le vieux propriétaire d'un ranch décrépi. Un projet de barrage risque d'inonder sa propriété et John n'a aucune intention de vendre son terrain. Il est déterminé à se battre même contre le barrage si nécessaire.
