Au coeur de la forêt amazonienne, Machado, un entrepreneur brésilien, fait détruire un village d'Indiens avaeté pour s'approprier leurs terres. Tous les habitants sont massacrés, à l'exception d'un garçon âgé de 8 ans, Ava.
A la fin du XVIIIe siècle, Diogo Infante, astronome, naturaliste et cartographe portugais, est envoyé par la Couronne du Portugal dans la région centrale du Brésil, le Pantanal. En arrivant là-bas, il découvre les relations violentes et meurtrières qui déchirent Indiens et Portugais.