L'histoire se déroule un an après les évènements de la série TV. Alors qu'un festival doit réunir tous les districts du royaume de Dôwâ, de sombres rumeurs se propagent : et si un nouveau Coup d'Etat était en préparation ?
En 2045, face à une crise économique et à l'évolution rapide de l'IA, dans un monde où la guerre durable est en plein essor, la Section 9 de la Sécurité Publique, dirigée par Motoko Kusanagi, arrive à Tokyo pour affronter le « post-humain » Takashi Shimamura et prévenir la menace...
