Masao s'ennuie. Il habite Tokyo avec sa grand-mère qui travaille toute la journée. Grâce à une amie de cette dernière, Masao rencontre Kikujiro, un yakusa vieillissant avec lequel il part à la recherche de sa mère, qu'il ne connait pas et qui vit au bord de la mer.
Le film se focalise sur les origines d'Ultraman qui devient ami avec un petit garçon appelé Musashi. Il est basé sur la série télévisée Ultraman Cosmos et a pour suite Ultraman Cosmos 2: The Blue Planet puis Ultraman Cosmos vs Ultraman Justice: The Final Battle.
