Mythica 3 démarre lorsque Thane est retenu en otage par Peregus Malister, le chef de la guilde des voleurs, forçant Marek à s’embarquer dans une mission corrompue afin de servir cette guilde. Mais lorsque cette mission les mènent dans les griffes de Szorlok – leur plus grand ennemi, Marek...
Dans un monde frappé par une terrible guerre, les Seigneurs de l'ombre ambitionnent de libérer des flammes de l'Enfer Goth-Azul, un Dieu aux pouvoirs terrifiants. Commence alors une bataille pour sauver le monde des griffes des forces du mal.