À la fin du XIXe siècle, dans un village reculé du Japon, une femme mariée prend pour amant son jeune voisin, de retour du service militaire. Dévorés par leur passion, Seki et Toyoji décident d’éliminer l’époux, Gisaburo. Bientôt, le fantôme de celui-ci revient hanter le village…
Dans un univers parallèle, la ville de Jesus Town est menée de main de fer par Gurjev qui contrôle les forces de police dirigées par le robot Mickael. C'est alors que survient Hakaider. Robot doté de capacités de combat le rendant redoutable, il entre de force dans la ville et cherche à...