New York, XXIIIe siècle. Une boule de feu fonce sur la Terre. Pour l'arrêter il faut retrouver le Cinquième Élément, l'être suprême, qui, associé aux quatre éléments vitaux - l'air, l'eau, le feu et la terre - peut seul repousser Le Mal. Cornélius reçoit l'aide de Korben, taxi et ancien...
Ogden Mears est un ambassadeur américain qui découvre, cachée dans sa cabine de bateau, une comtesse russe. Elle veut aller aux États-Unis. Mears va tomber amoureux, mais sa femme l'attend à Hawaï.
L'agent secret Mike Graham ne se remet pas de la mort de son collègue et ami, survenue lors d'une mission dangereuse. Pour l'aider à sortir de sa déprime, ses supérieurs le chargent d'une nouvelle enquête : retrouver un tableau volé. L'affaire, apparemment facile, se révèle plus complexe...