Calendrier spatial 996.5. Le navire Muse, qui revient de la planète Kerun où il a recherché un nouveau minerai, reçoit un S.O.S. du navire cargo Zorgne. Arrivée sur place, une équipe de six jeunes cadettes débarque sur le vaisseau à la dérive. Seule parmi les cadavres de l'équipage, une...
Un an après les événements de la première saison, un Digimon virus appelé Diaboromon apparaît et commence à attaquer Internet. Les enfants et leurs Digimon s'unissent à nouveau pour l'empêcher de détruire tous les réseaux de communication de la planète.
Kyosuke et Madoka, âgés de 19 ans, sont désormais à l'Université de Waseda alors que Hikaru s'est exilée aux USA pour poursuivre ses études de danse. Kyosuke, ayant gagné un concours de photo, décide avec Madoka de célébrer l'événement en organisant un week-end en amoureux. Mais...
Éléments de la série Bubblegum Crisis dans une vidéo rock de style MTV. Des extraits de la série sont combinés à la musique de Kinuko Omori et des Knight Sabers.
