"Maison Ikkoku le film" se situe non pas après la fin de la série éponyme, mais il narre les faits qui vont survenir juste avant le mariage de Godai et Kyoko. Une énième épreuve attend notre jeune couple, puisque Kyoko va disparaître juste avant le mariage... Que lui est-il arrivé ?...
Cet épisode spécial réunit tous les passages clés de l'histoire d'amour entre Kyôko Otonashi (Juliette) et Yusaku Godai (Hugo). Hormis ces deux-là, on retrouve bien entendu Shun Mitaka (François), le rival de Godai, et tous les autres personnages phares de la série...
Nous sommes en pleine période Sengoku. Suzu est une toute jeune villageoise. Son village est en train d'être mis à sac et brûlé par des brigands. Elle se retrouve encerclée par les flammes, et Shukumaru, qu'elle considère comme son grand frère, n'arrive pas à l'atteindre. C'est alors...
Neo-Venezia est entré dans un long hiver. Ai, Azusa et Anya, qui s'entraînent ensemble dans le froid, visitent le musée des Ondines, sous la conduite d'Akira qui ne semble pas être comme d'habitude. Au musée, le trio rencontre la directrice, Asuka, sempai d'Akira, connue comme l'ondine...