C'est la veille de Noël et le théâtre des Muppets menace d’être démoli. Alors que tout semble perdu, Kermit et les Muppets reçoivent une aide inattendue et réalisent alors que le plus important est l'amour qu’ils se portent les uns aux autres...
Dans les bas-fonds de Los Angeles, humains et marionnettes vivent ensemble. Deux détectives, un humain et une marionnette, sont obligés de faire équipe bien malgré eux pour découvrir qui assassine les anciens acteurs du «Happytime Gang», une émission de marionnettes très populaire.