Shelter raconte l'histoire de Rin, une jeune fille de 17 ans qui vit sa vie à l'intérieur d'une simulation futuriste complètement seule dans une solitude infinie et magnifique. Chaque jour, Rin se réveille dans la réalité virtuelle et utilise une tablette qui contrôle la simulation pour se...
Edward, à la suite d'un accident, a perdu la mémoire. Il retourne en Italie retrouver son épouse, qu'il ne reconnaît d'ailleurs pas. Et rapidement, son passé obscur, lié à des affaires de drogue et de meurtres sordides, le rattrape...
Un accident cause à une photographe des pertes de mémoire. Mais parmi ses photos, d'étranges indices lui laissent à penser qu'elle pourrait être responsable de la mort des membres de sa famille.