L'histoire se déroule vers 1650, après la mort du troisième shogun Tokugawa, lorsque les rônins ont été expulsés d'Edo, la capitale militaire. Pendant l'instabilité politique qui suit la mort d'Iemitsu Tokugawa, le clan ninja Iga de Hanzo se bat contre le clan Koga, alors que diverses...
1732, à l'époque de Yoshimune Tokugawa. L'ouest du Japon souffre d'une grave famine. Trois ans plus tard, il semble que le calme soit revenu dans le domaine, mais certaines rumeurs disent que Jyuzo Matsumiya, l'instructeur de combat à l'épée envoyé par le shogunat, entreprend des actions...
Refusant de passer la nuit avec une femme issue de la noblesse, Kyoshiro Nemuri apprend le lendemain que celle-ci s'est suicidée et lui a confié la responsabilité de son enfant, un garçon qui doit hérité de la direction d'un clan. Évidement, un clan adversaire cherche rapidement à s'emparer...
Kyoshiro Nemuri croise la route de deux enfants du Shogun, un frère et une soeur, qui se sont fait passer comme mort pour continuer leurs jeux sadiques envers la population.