Akihabara@DEEP raconte l'histoire de cinq otaku qui quittent la société pour finalement fonder leur propre entreprise informatique appelée Crook. Mais Nakagomi, président d'une société électronique influente appelée Digital Capital, fera tout pour mettre la main sur Crook
À Akihabara, Sakura Sakuragi (Yurika Kubo) dirige le café-chat "Mocha". Elle y écoute les problèmes de ses clients, également réconfortés par les chats qui y résident.
