Suite à une négligence, un savant se retrouve, le temps d'une expérience, enfermé dans une machine à désintégrer en compagnie d'une mouche. Le résultat de l'expérience qu'il effectuait sur lui-même est qu'il se retrouve moitié homme, moitié mouche.
Yoshiyama Akari va bientôt passer son baccalauréat. Elle est sur le point mener une nouvelle vie après avoir réussi l'examen d'entrée à l'université, sa mère, Yoshiyama Kazuko, travaille comme pharmacologue. Cependant, sa vie bascule lorsque sa mère a un accident de voiture. Conformément...
Quinze ans après La Mouche noire, le fils du savant transformé en homme-mouche continue les expériences de son père. Mais poussé par les ambitions de son assistant, il se retrouve avec une tête et les membres d'une mouche. Sa vengeance envers les gens qui l'ont trahi sera terrible, et il doit...