Alors qu'Ethan Hunt est chargé de récupérer du plutonium volé, il décide de sauver son équipe plutôt que de mener à bien cette mission. Les armes nucléaires se retrouvent ainsi dans les mains d'un groupe terroriste nommé « les Apôtres », formé après l'arrestation de Solomon Lane...
En août 1969, les disciples de Charles Manson tuent sept personnes à sa demande. Replongez dans cette histoire mêlant manipulation mentale, expériences de la CIA et meurtre.