Alice, seule survivante de la bataille de Washington contre les zombies, doit retourner à l’endroit où le cauchemar a débuté : le Hive à Raccoon City. C’est là, qu’Umbrella Corporation a regroupé ses forces pour mener un assaut final contre les survivants de l’apocalypse.
L'Agence de garantie de la continuité humaine, Chaldea, observe un monde qui ne peut être vu uniquement par la magie. Un jour, la lentille d'observation du futur proche Shiva incinérera l'avenir de l'humanité en 2017 - il a été prouvé que l'humanité s'éteindra. Des "zones inobservables"...
Dans un monde ravagé par un virus, transformant ses victimes en morts-vivants, Alice continue sa lutte à mort avec Umbrella Corporation. Elle poursuit son voyage à la recherche de survivants et d'un lieu sûr où les mener. Cette quête les mènent à Los Angeles mais ils constatent très vite...