XXIVe siècle. Alors que l'Enterprise patrouille au fond de la galaxie, le capitaine Picard et ses hommes reçoivent un message de détresse : les terribles Borg, mi-hommes mi-machines, sont en train d'attaquer la Terre afin de changer l'histoire de l'Univers. Pour les contrer, une seule solution :...
Le vaisseau Enterprise est redirigé vers la planète mère romulienne Romulus, sous prétexte que ces derniers veulent négocier un traité de paix. Le capitaine Picard et son équipage découvrent une grave menace pour la Fédération lorsque le préteur Shinzon prévoit d'attaquer la Terre.