Alors que la guerre fait toujours rage entre Medical Mechanica et Fraternity, Haruko est de retour sur Terre. Nommée professeur dans un établissement scolaire, elle y fait la connaissance d'Hidomi, une adolescente dissimulant un étrange secret.
Kana, 17 ans, aime passer du temps avec ses amis Mossan, Hijiri et Pets. Ils passent de bons moments jusqu'au jour où un mécha tombe du ciel avec une femme étrange, Haruko. Elle va initier Kana et ses amis à une force appelée ATOMSK. Kana devra alors décider de l'aider ou pas, mais a-t-elle...